警方為應付(fù )未確認生(🏽)命體而開發了G3系統，這套G3系統是根(🎹)據未確認生命體4號(hào )即幪面超人古迦的力量而設計出來，裝著員是(shì )一位叫冰川誠的警員，為人真誠但略(🔲)為(wéi )粗獷。警方另一部門在(zài )荒島上發現了古代文明，並進(jìn )行(háng )解碼。當未(💞)確認生命體再次(🔩)出現，連G3也不是其對手時，神秘的(🥎)金色幪面超人亞極陀登場，這個(🙄)幪面超人是一位失憶的(🍄)青年津上翔一變身，起初因未能控制而襲擊G3。
　　翔一暫住在美杉義彥的家，認識了擁有超能力的風谷真魚，真魚更幫助翔一四出尋找他失去的記(jì )憶，並(bìng )遇上葦原涼。涼在父親的遺(👵)物中，發現(xiàn )一本記事薄，當中提及之姓名(míng )卻(🔫)無人(🔥)知曉，查探(tàn )父親死因後，竟發現自己是另一個(👚)幪面超人－磯烙使。磯(🕺)烙使是不完整(🍹)的亞(yà )極陀，所(suǒ )以當涼變(biàn )身(shēn )磯烙使後會出現後遺証(🖱)。有次他相當危險，幸得因超古代文明遺傳因子而誕生的青年所救。之後出(🐸)現的未(wèi )確(👔)認生命體也相繼被翔一，涼以及誠所打敗。
　　後來，涼(🏒)誤(🎇)會女朋(péng )友是被亞極陀所(suǒ )殺，造成磯(jī )烙使與亞極陀對峙的局(📛)面。又(yòu )因亞極陀多次拯救G3，G3加入戰團對付(fù )磯烙使(🕠)。可惜G3聯手亞(yà )極陀未敵磯烙使，警方有見及此(cǐ )更厲害的武器－G3-X。在G3-X和亞極陀合作下(💙)，未確認生命(mìng )體雖然愈來愈厲害，但也被擊(jī )倒。
　　第三個幪面超人是由木(🌥)野薰變身，他雖然會優先對付未確認生命(mìng )體，但亦會對付磯烙使和亞極陀，因(yīn )他認為(wéi )世上有他就夠了。後來他被強(qiáng )化了的磯烙使所敗，又被涼所救而作出改變(biàn )。
　　原來謎的青年是遠古使用闇力量的創造主，他今次(🏜)派出水的精靈對付三個幪面超人及G3，起初四人不敵，但翔一打破恐懼，令亞極陀的力量再(zài )上一層(céng )，再合(hé )四人之力，將他打敗。
　　在警方和(➕)真魚的調查下發現翔一的姐姐木雪菜(cài )也曾經變成亞極陀，而其他(🍺)擁有超能力的人最終也會變成亞極陀，真魚更發現她的父親的死和亞極陀有(📃)關(🏽)而疏離(lí )翔一(🙃)。這時闇的創造主(🕤)親自出(📼)擊，要收回翔一等的(de )力量。更決(🎙)定殺盡所有(🏒)人類，以免有更多的亞極陀誕生。他派(pài )出(🖱)風、地、水三精靈，翔一(📫)、涼和誠的最後一戰在(📎)此展開。