警方(fāng )為應付未確認生命體而開發了G3系統，這套G3系統是根據未確認生命(mìng )體4號即幪面超人古迦的力量而設計出來，裝著員是一位叫(🔸)冰(👑)川誠的警員，為人真誠但略為粗獷。警方另一部門在(🎫)荒島上發現了古代文明，並進行解(jiě )碼。當未確(què )認生命體再次出現，連G3也不是其對手時，神秘的金色幪(🗞)面超人亞極(jí )陀登場，這個幪面超人是一位失憶的青年津上翔一變身，起初因未能控制(🤳)而襲擊G3。
　　翔一暫住在美杉義彥的家，認(🚗)識了擁(😊)有超能力的風谷真魚，真魚更(gèng )幫(🌼)助翔一四出尋找他失去的記憶，並遇上葦原涼。涼在父親的遺(👵)物中，發現一本記事薄，當中提及之姓名卻無人知曉，查探父親死因後，竟發現自己是另一個幪(méng )面超人－磯烙使。磯烙使(🎴)是(shì )不完整的亞極陀，所(suǒ )以當涼變身磯烙使後會出現後遺証。有次他相當危險，幸得因超古代(dài )文明遺傳因子而誕(dàn )生的(🏆)青年所救。之後出現的未確認(😼)生命體也相繼被翔一，涼以及誠所(🖥)打敗。
　　後來，涼(🏒)誤會女朋友是被(🍂)亞極陀所殺，造成磯烙使(😓)與亞極陀對峙的局(📛)面。又因亞極陀多次拯救G3，G3加入(💍)戰團對付磯烙使。可惜G3聯手亞極陀未敵磯(🙂)烙使，警方有見及(🚖)此更厲害的武器－G3-X。在G3-X和亞(🍩)極陀合作下，未(wèi )確認生命體雖然愈來愈厲害，但(😋)也被擊倒。
　　第三(sān )個幪面超人是由木野(yě )薰(xūn )變身，他雖然會優先對付未確認生(shēng )命(mìng )體，但(dàn )亦會對付磯烙使和亞(yà )極陀，因他認為(wéi )世上有他就夠(🛰)了。後來他被強化(huà )(🐖)了的磯烙使所敗(bài )(😜)，又(🕎)被涼所救而作(zuò )(🍀)出改變(🚩)。
　　(👚)原來謎的青年是遠(🤨)古(🔷)使用闇力量(liàng )的創造主，他今次派出水的精(jīng )靈對付三(🔢)個幪(🧢)面超人及(jí )G3，起初四人不敵，但翔一打破恐懼，令亞極陀的力量再上一層，再合四人之力，將(📌)他打敗。
　　在警方(fāng )和真魚的調查下發現翔一的姐姐木雪菜也曾經變成亞極陀，而其(qí )他擁有超(chāo )能力的人最終也會變成(chéng )亞極陀(tuó )，真(🏉)魚更發現她的父親的死和亞極陀有關而疏離翔一。這時闇的(🎯)創造主親(qīn )自出(chū )擊，要收回翔一等的力量。更決定殺盡所有人(rén )類，以免有更(gèng )多的亞極陀誕生。他(tā )派出風、地、水三精靈，翔一、涼和誠的最後一戰在此展開。