20世紀末の現代、高校生の火(huǒ )野ヤマトは体育館で自分の名を呼ぶ巨大な「魔神」の幻(🐮)影を見る。幻を振(⏬)り払(🎏)おうとするヤマトであったが、「魔神」とともに「見知らぬ女性」の声が聞(📞)こえたとき、ヤマトは声に歩み寄ってしまう。 ヤマトが「魔(mó )神(shén )」によって運ばれた先は1万年前に地殻変動で海に沈んだはずのムー大(🙉)陸で(⛓)あった。訳(⛏)が判らないヤマトに(⛳)対しムーの民たちは(🕐)彼を「マジンガーが選んだ救世主」と持(chí )ち上げる。彼らムーの民の守護神(🐨)こそ、彼を現代から過去に運ん(🔈)だゴッドマジンガーであ(🤥)っ(⏲)た。そんな折、ムーの民と拮抗する勢力であるドラゴニアが襲来すると(📞)、再び「魔神」の声がヤマトを呼び寄せる。ヤマトがゴッドマジンガーと融合したとき、ゴッド(🈳)マジンガーはド(🈂)ラゴ(🐌)ニアの恐竜軍団を撃退するのであった。