20世(🆓)紀末の現代、高校(xiào )生の火野ヤマトは体育館で自分の名を(🎗)呼ぶ巨大な「魔神」の幻影を見る。幻を振り払おうとする(📼)ヤマトであっ(🕔)たが(👑)、(🎩)「魔神」とともに「見知らぬ女(nǚ )性」の声が聞こえ(🎫)たとき(😚)、ヤマトは声に歩み寄ってしまう。 ヤマトが「魔神」によって運(yùn )ばれた先は1万年前に地殻変(📙)動(🔝)で海に沈んだはず(🙄)のムー大陸であった。訳が判らないヤマトに対しムーの民(🤳)たちは彼を「マジンガーが選んだ救世主」と持ち上げる。彼らムーの民の守護神こそ、彼を現代から過去に運んだゴッドマジンガーであった(📛)。そんな折、ムーの民と拮抗する(🏴)勢力であるドラゴニアが襲来(🔥)すると、再び(🚽)「魔神」の声が(👗)ヤマトを呼び寄せる。ヤマトがゴッドマジンガーと融合したとき、ゴッドマジンガーはドラゴニアの恐竜軍団を撃退するのであった。