故事发生(✒)在一所(suǒ )名叫第3新东京世立NERV学园(yuán )中，校长是严肃又寡言的碇原度（立(🐮)木文彦 配音）。作(zuò )为校长的儿子，碇真嗣（绪方(🔸)惠美 配音）感到压力很大。于此同时，来自外国的红发转学生明日香（宫村优子 配音），分裂(💞)成三个、以姐妹的形式出场的凌(líng )波丽(lì )(🔢)（林原惠美 配音(yīn )）都(dōu )(💻)给碇真嗣的学(xué )校生活带(🤸)来了(🙄)翻天覆地的变化。此外，在原作(zuò )中高大帅气的(de )初号机，也将以娇小可爱的形象，作为学院的一份子出现在动画中。
　　动画以《新世界福音战士》中(zhōng )(🚶)的角色为原型，一改原作沉重严肃的气氛(fēn )，描(🔤)述了轻松愉快的校(💸)园生活。制(🔞)作方首次采用(🔙)了3D的Q版造型，配以实景背景和2D拼接，造就了多元化的绘画风格。